7 мая 1994 года Святейший Патриарх Алексий II совершил освящение Креста на Центральном проезде поселка Семхоз Сергиево-Посадского района в основание Патриаршего Подворья святого великомученика Георгия Победоносца. Инициативу по строительству храма для жителей поселка Семхоз проявил настоятель храма Архистратига Михаила в Тропареве г. Москвы протоиерей Георгий Студенов, проживший в Семхозе более двадцати лет. После сбора подписей земельный участок был выделен при поддержке Главы администрации В. Н. Чурилина. Автором проекта, который включал в себя большой храм и дом причта с малым храмом, стал Главный архитектор г. Сергиева Посада В. Д. Журавлев.

Летом 1994 года началось строительство дома причта с малым храмом в честь святого великомученика Георгия Победоносца. В его основание протоиерей Георгий Студенов вложил камень и кусочек керамики от купели святого равноапостольного князя Владимира из древнего Херсонеса (Севастополь). Большая часть забот по строительству легла на плечи матушки Ольги Алексеевны Студеновой. 19 января 1996 года в храме состоялась первая служба.

Краеведческие исследования показали, что в непосредственной близости Подворья в XV-XVII веках располагалось село Николо-Поддубное с храмом святителя Николая, которые были разрушены в начале XVII века при Польском нашествии. В память о древнем Никольском храме Святейший Патриарх Алексий II освятил антиминс для приставного престола в честь святителя Николая, архиепископа Мир Ликийских. Строительство большого храма отложилось на неопределенное время, поэтому к малому храму были пристроены алтарная апсида и колокольня.

С 1996 года в храме регулярно совершаются богослужения во все субботние, воскресные и праздничные дни, действует Воскресная школа со столярной мастерской, хоровой класс, проводятся катехизаторские беседы, спортивные и фольклорные мероприятия, паломнические поездки. Первым настоятелем Подворья стал строитель храма протоиерей Георгий Студенов. Богослужения совершали, в основном, клирики храма Архистратига Михаила в Тропареве г. Москвы: прот. Георгий Сорокин, прот. Андрей Шумилов, свящ. Алексий Лю, свящ. Георгий Шаламберидзе, свящ. Илия Паршаков, прот. Александр Войтенко (с 2003 года), а также прот. Георгий Коновалов и другие. В 2013 году настоятелем храма был назначен прот. Александр Войтенко. В 2014 году штатным клириком стал диакон Сергий Шпехт. К 25-летию Подворья  был проведен капитальный ремонт здания, устроен балкон для певчих. Трудами прихожан храма – преподавателей и выпускников Иконописной школы при МДА – заменен временный иконостас.